Für das TwIS gilt der Leitsatz: Wir fassen die Fachinformationssysteme (FIS) nicht an. Wir lassen sie so, wie sie sind. Einerseits erfüllen die Systeme die Aufgaben der Fachkollegen:innen; und diese werden es uns danken, wenn wir sie weiter so arbeiten lassen, wie sie es möchten. Andererseits können wir diese Systeme doch nicht mit Verknüpfungen u. ä. für interoperable  überlasten, denn so entstehen die oft zitierten ‚Spaghettistrukturen‘.

Die Daten verschiedener FIS können in das TwIS eingespielt werden, es wird zwangsläufig zu themenübergreifenden Verknüpfungen der Objekte führen. Damit wird der Inhalt des TwIS bei Integration mehrerer FIS eine neue, FIS-übergreifende Qualität bekommen.